5 Jahre sind seit dem großen Neuanfang vergangen und man schreibt das fünfte Jahr des Zen Saiki, der kompletten Erneuerung. Gerade erst haben sich die Dörfer erholt, haben die schweren Schäden repariert, welche die letzten Jahre des Krieges verursacht haben und eine vorsichtige Allianz geschmiedet, doch schon zieht eine neue Bedrohung aus der Dunkelheit herauf. Eine Bedrohung, die das frische Bündnis der Dörfer auf eine harte Probe stellen wird, eine Bedrohung, die die gesamte Welt der Shinobi gefährdet.
Schließe dich einem Dorf an, kämpfe für deinen Clan, dein Land und die Welt der Shinobi!